Çanakkale'nin önemli yapılarından biri olan Aynalı Çarşı Kulesi, kare planlı bir yapı olarak inşa edilmiştir ve yukarıya doğru incelen bir form sergiler. Kesme taş ile yapılan kule, beş kat üzerinde yaklaşık 20 metre yüksekliğe ulaşır. En üst katında yer alan çokgen gövdeli ve kubbeli köşk bölümü, saat çanını barındırır. Yapının ilk katında bulunan çeşme, diğer katlardan daha yüksek ve geniş olup, bu katın görsel önemini artırır.
Kulenin gövdesi, enine silmelerle beş kat olarak ayrılmıştır. İlk kattaki silme, diğerlerine göre daha geniş olup, hemen üzerinde ikinci katın balkonunu taşıyan konsollar bulunur. İkinci ve sonradan eklenen dördüncü katlarda ise bu süslemelerin daha küçük boyutlarda paralel versiyonları yer alır. Üçüncü katta ise kirpi saçak benzeri basit bir silme süslemesi dikkat çeker. Dördüncü katta ise köşelerde dekoratif sütunlar kullanılarak farklı bir biçim oluşturulmuş ve her yüzde birer dairesel kadran yer almıştır.
Sekizgen şeklindeki beşinci kat, soğanvârî bir kubbe ile sonlanır. Bu katın yüzeyinde yer alan açıklıklar, son onarımlar sırasında turkuaz renkli Çanakkale seramikleriyle kapatılmıştır. Kulenin her yüzünde ikinci ve üçüncü katlarda birer açıklık bulunur. Üçüncü kattaki açıklıklar sivri kemerli ve taş sövelidir. İkinci kattakiler ise iri kaval silmeleriyle çevrilmiş sivri kemerli kapılardır.
Kulenin ilk katının güney yüzünde sivri kemerli iki silmeyle çevrilmiş bir kapı yer alırken, kuzey yüzünde ise çeşme nişi bulunmaktadır. Çeşme, üç ince kaval silme ile U biçiminde bir sivri kemerle kuşatılmıştır. Beyaz mermerden yapılan çeşme, sade bir aynaya ve yalağa sahip olup, son onarımlar sırasında yenilenmiş bir lülesi vardır. Yapının kitabesi, çeşme alınlığında yer alan yeşil zemin üzerine yazılmış ve altı satır halinde verilmiştir. Kitabe metninin hemen üzerinde II. Abdülhamit’in tuğrası yer almaktadır.
